在一座与世隔绝的小镇上，一位被称为“科学怪鱼”的年轻科学家意外研发出了一种可以改造鱼类基因的神秘装置。本意想通过改变鱼类基因来改善当地渔业资源，却意外地创造了一种智慧生物——“智慧鱼”。这些鱼不但拥有超乎寻常的智力，还能够与人沟通，从而揭示了深海中不为人知的秘密。然而，随着这些智慧鱼族群的逐渐增多，他们的存在引起了镇上各种势力的觊觎，有人企图利用它们从事非法交易，有人试图保护这些生物以维护生态平衡。科学怪鱼必须在各方势力的压力下，保护他所制造的生物，甚至与它们一同揭开隐藏在深海与人类古老传说中惊天动地的真相。在智力与情感交织的洪流中，人类与智慧鱼的命运究竟如何改变？这是一场智力与勇气的较量，是人与自然之间那微妙却坚韧的纽带，最终能否找到和谐共鸣的音符？