在安宁的小镇上，高岭家以种植美丽的花卉而闻名。然而，家族的秘密被保存在一个诗意的名字下——“二轮花黑树”。高中生高岭优斗生于此家，他和妹妹高岭真央都觉得家中的养花传统单调无趣。然而，当优斗无意中发现爷爷遗留的一本神秘日记，他和真央开始揭开“二轮花黑树”的神秘面纱。日记中描述了“二轮花黑树”的传说：这棵树象征着时间的流转和生命的轮回，拥有着奇异的力量。传言中，若能解开与树有关的谜题，便能受到灵感和幸福的祝福。然而，每一次揭开谜题也将开启一场不平凡的冒险。在揭示谜题的过程中，兄妹俩遇到了古灵精怪的花妖生灵、守护遗迹的传统园艺师、热爱神秘学的同学小团体，并穿越不同的历史场景与他们互动。在解决谜题的过程中，两人也逐渐理解了祖先们的努力和家族的意义。影片以神秘和温情并存的色彩，描绘了成长与勇气，以及家庭与自然的深厚羁绊。