在未来的2021年，世界因环境失衡和生物科技的失控而变得异常脆弱。然而，真正的危机来自于深海中苏醒的远古生物——哥斯拉。为了对抗这一威胁，人类不得不借助手头掌握的另一股远古力量：沉睡于神秘岛屿中心地带的金刚。在一场意图控制金刚的秘密实验中，科学家埃米莉意外地与金刚建立了心灵连接，成为彼此之间的沟通桥梁。随着哥斯拉的逼近，埃米莉必须联合世界各国的军队、科学家和金刚，寻找压倒性武器，并解开这两大怪兽隐藏在历史长河中的羁绊。最终，当金刚与哥斯拉面对面时，人类意识到，决胜的关键不在于操控，而在于理解与共生。正是在这场终极对决中，人类和自然界的命运走到了十字路口。